W drewnianym, XVII-wiecznym kościele w Michalicach na największą uwagę zasługuje bogato zdobiony, dwukondygnacyjny ołtarz główny, który datowany jest na 1688 r. – powstał zatem ponad 70 lat po wzniesieniu świątyni. Ufundował go ówczesny proboszcz parafii Andrzej Jan Janik. W centralnej części ołtarza, w półokrągłej ramie znajduje się obraz Matki Bożej z Dzieciątkiem w otoczeniu aniołów, również datowany na 1688 r. Po obu jego stronach, przy kolumnach, posadowione są figury św. Jana Chrzciciela i św. Józefa. Druga kondygnacja ołtarza oddzielona jest wyraźnie przez rozbudowany gzyms z ornamentalnym kartuszem. Pośrodku zwieńczenia umieszczono rzeźbę św. Michała Archanioła walczącego ze smokiem.